Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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