Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms