Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CADM3Q8N126 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CADM3Q8N126 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms