Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms