Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q71RC1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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