Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC141Q6ZP82 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms