Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms