Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRFN4Q6PJG9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms