Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRAMEF6Q5VXH4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRAMEF6Q5VXH4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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