Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms