Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI66

KRTAP6-2, Keratin-associated protein 6-2, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-2Q3LI66 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP6-2Q3LI66 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms