Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNPY1Q3B7I2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms