Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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