Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCD2Q16342 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCD2Q16342 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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