Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITSN1Q15811 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms