Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
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PTPRKQ15262 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
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