Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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