Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
KCNB1Q14721 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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