Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms