Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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