Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP3AQ13472 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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