Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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