Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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