Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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