Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF5Q12774 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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