Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DHX9Q08211 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms