Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG7P83436 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG7P83436 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG7P83436 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG7P83436 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms