Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms