Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCS1P62166 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms