Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIK1P57059 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIK1P57059 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SIK1P57059 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIK1P57059 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIK1P57059 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIK1P57059 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIK1P57059 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK1P57059 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms