Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA1P56159 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms