Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTAP49354 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNTAP49354 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms