Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME1P48163 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME1P48163 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME1P48163 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME1P48163 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms