Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A2P43004 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms