Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP62P37198 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms