Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMBRP28336 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMBRP28336 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMBRP28336 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMBRP28336 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMBRP28336 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMBRP28336 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMBRP28336 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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