Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms