Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms