Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms