Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPREP23469 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPREP23469 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPREP23469 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPREP23469 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPREP23469 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPREP23469 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms