Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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