Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGS1P23219 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTGS1P23219 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGS1P23219 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms