Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB5AP20339 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB5AP20339 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms