Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3L1P16619 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3L1P16619 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3L1P16619 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3L1P16619 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms