Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA4P06727 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA4P06727 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA4P06727 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms