Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGAP02671 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGAP02671 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGAP02671 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms