Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms