Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA4O75335 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms