Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP3LO60238 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNIP3LO60238 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms