Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD8O14715 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD8O14715 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms